MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015574	TGG	2	6	309005	309010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986512
5002	NC_015574	AAT	2	6	309051	309056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986512
5003	NC_015574	TAA	2	6	309060	309065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986512
5004	NC_015574	AT	3	6	309617	309622	50 %	50 %	0 %	0 %	333986513
5005	NC_015574	T	6	6	309622	309627	0 %	100 %	0 %	0 %	333986513
5006	NC_015574	T	8	8	309677	309684	0 %	100 %	0 %	0 %	333986513
5007	NC_015574	TCA	2	6	309692	309697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986513
5008	NC_015574	TTG	2	6	309706	309711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986513
5009	NC_015574	TCA	2	6	309732	309737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986513
5010	NC_015574	ATGA	2	8	310826	310833	50 %	25 %	25 %	0 %	333986514
5011	NC_015574	ATG	2	6	310857	310862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986514
5012	NC_015574	TTTA	2	8	310897	310904	25 %	75 %	0 %	0 %	333986514
5013	NC_015574	A	7	7	310951	310957	100 %	0 %	0 %	0 %	333986514
5014	NC_015574	ATA	2	6	310977	310982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986514
5015	NC_015574	TAA	2	6	311035	311040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986514
5016	NC_015574	A	7	7	311101	311107	100 %	0 %	0 %	0 %	333986514
5017	NC_015574	TTC	2	6	311142	311147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986514
5018	NC_015574	AGA	2	6	311263	311268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986514
5019	NC_015574	TGAT	2	8	311319	311326	25 %	50 %	25 %	0 %	333986514
5020	NC_015574	GATATA	2	12	311399	311410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333986514
5021	NC_015574	CAA	2	6	311555	311560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986514
5022	NC_015574	TAGA	2	8	311565	311572	50 %	25 %	25 %	0 %	333986514
5023	NC_015574	TG	3	6	311899	311904	0 %	50 %	50 %	0 %	333986515
5024	NC_015574	AAC	2	6	311918	311923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986515
5025	NC_015574	ATT	2	6	311943	311948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986515
5026	NC_015574	G	6	6	311965	311970	0 %	0 %	100 %	0 %	333986515
5027	NC_015574	TAT	2	6	312007	312012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986515
5028	NC_015574	CGG	2	6	312031	312036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986515
5029	NC_015574	AAG	2	6	312162	312167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986515
5030	NC_015574	AG	3	6	312232	312237	50 %	0 %	50 %	0 %	333986515
5031	NC_015574	ATC	2	6	312337	312342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986515
5032	NC_015574	TAT	2	6	312374	312379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986515
5033	NC_015574	ACA	2	6	312435	312440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986515
5034	NC_015574	TAGG	2	8	312460	312467	25 %	25 %	50 %	0 %	333986515
5035	NC_015574	TGG	2	6	312801	312806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986516
5036	NC_015574	TCT	2	6	312811	312816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986516
5037	NC_015574	GAA	2	6	312870	312875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986516
5038	NC_015574	CTT	2	6	312922	312927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986516
5039	NC_015574	TTC	2	6	312933	312938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986516
5040	NC_015574	T	7	7	312974	312980	0 %	100 %	0 %	0 %	333986516
5041	NC_015574	CCT	2	6	312990	312995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986516
5042	NC_015574	TCA	2	6	313039	313044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986516
5043	NC_015574	GAA	2	6	313678	313683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986517
5044	NC_015574	TAT	2	6	313689	313694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986517
5045	NC_015574	TAT	2	6	313699	313704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986517
5046	NC_015574	ATT	2	6	313769	313774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986517
5047	NC_015574	ATTA	2	8	313777	313784	50 %	50 %	0 %	0 %	333986517
5048	NC_015574	TCC	2	6	313826	313831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986517
5049	NC_015574	TGAA	2	8	313842	313849	50 %	25 %	25 %	0 %	333986517
5050	NC_015574	CCT	2	6	313850	313855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986517
5051	NC_015574	TAGT	2	8	313905	313912	25 %	50 %	25 %	0 %	333986517
5052	NC_015574	AT	3	6	313977	313982	50 %	50 %	0 %	0 %	333986517
5053	NC_015574	AAT	2	6	314072	314077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986517
5054	NC_015574	CAA	2	6	314119	314124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986517
5055	NC_015574	ATTT	2	8	314180	314187	25 %	75 %	0 %	0 %	333986517
5056	NC_015574	AT	3	6	314281	314286	50 %	50 %	0 %	0 %	333986517
5057	NC_015574	CT	3	6	314297	314302	0 %	50 %	0 %	50 %	333986517
5058	NC_015574	A	8	8	314334	314341	100 %	0 %	0 %	0 %	333986517
5059	NC_015574	CTTAA	2	10	314878	314887	40 %	40 %	0 %	20 %	333986518
5060	NC_015574	TCT	2	6	314888	314893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986518
5061	NC_015574	T	6	6	315119	315124	0 %	100 %	0 %	0 %	333986518
5062	NC_015574	GGT	2	6	315127	315132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986518
5063	NC_015574	CAT	2	6	315177	315182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986518
5064	NC_015574	CAGG	2	8	315885	315892	25 %	0 %	50 %	25 %	333986519
5065	NC_015574	CTG	2	6	315934	315939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986519
5066	NC_015574	T	6	6	315946	315951	0 %	100 %	0 %	0 %	333986519
5067	NC_015574	TCT	2	6	315966	315971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986519
5068	NC_015574	ATA	2	6	316166	316171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986519
5069	NC_015574	CGT	2	6	316203	316208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986519
5070	NC_015574	TTC	2	6	316234	316239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986519
5071	NC_015574	CTGC	2	8	316275	316282	0 %	25 %	25 %	50 %	333986519
5072	NC_015574	CAT	2	6	316404	316409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986519
5073	NC_015574	TGGT	2	8	316413	316420	0 %	50 %	50 %	0 %	333986519
5074	NC_015574	CTG	2	6	316500	316505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986519
5075	NC_015574	TCT	2	6	316511	316516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986519
5076	NC_015574	CTG	2	6	316591	316596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986519
5077	NC_015574	GTA	2	6	316630	316635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986519
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5079	NC_015574	GTA	2	6	316771	316776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986519
5080	NC_015574	CAT	2	6	316785	316790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986519
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5082	NC_015574	T	6	6	316906	316911	0 %	100 %	0 %	0 %	333986519
5083	NC_015574	TTG	2	6	316917	316922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986519
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5087	NC_015574	AT	3	6	317088	317093	50 %	50 %	0 %	0 %	333986520
5088	NC_015574	ATT	2	6	317343	317348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986520
5089	NC_015574	ACC	2	6	317370	317375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986520
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5091	NC_015574	CTC	2	6	317425	317430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986520
5092	NC_015574	TGG	2	6	317452	317457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986520
5093	NC_015574	CAA	2	6	317464	317469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986520
5094	NC_015574	TCTGC	2	10	317581	317590	0 %	40 %	20 %	40 %	333986520
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5098	NC_015574	TCA	2	6	317745	317750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986520
5099	NC_015574	TTC	2	6	317884	317889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986520
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5101	NC_015574	TA	3	6	318209	318214	50 %	50 %	0 %	0 %	333986520
5102	NC_015574	TA	3	6	318254	318259	50 %	50 %	0 %	0 %	333986520
5103	NC_015574	CT	3	6	318274	318279	0 %	50 %	0 %	50 %	333986520
5104	NC_015574	CTGG	2	8	318298	318305	0 %	25 %	50 %	25 %	333986520
5105	NC_015574	CAG	2	6	318319	318324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986520
5106	NC_015574	GTTA	2	8	318335	318342	25 %	50 %	25 %	0 %	333986520
5107	NC_015574	GA	3	6	318365	318370	50 %	0 %	50 %	0 %	333986520
5108	NC_015574	TGTT	2	8	318399	318406	0 %	75 %	25 %	0 %	333986520
5109	NC_015574	TCT	2	6	318407	318412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986520
5110	NC_015574	ATTT	2	8	318617	318624	25 %	75 %	0 %	0 %	333986521
5111	NC_015574	TCT	2	6	318625	318630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986521
5112	NC_015574	TGCTA	2	10	318633	318642	20 %	40 %	20 %	20 %	333986521
5113	NC_015574	TTTCA	2	10	318672	318681	20 %	60 %	0 %	20 %	333986521
5114	NC_015574	ATC	2	6	318721	318726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986521
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5116	NC_015574	TAT	2	6	318852	318857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986521
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5118	NC_015574	TAT	2	6	318915	318920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986521
5119	NC_015574	ATC	2	6	318933	318938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986521
5120	NC_015574	CAGA	2	8	319009	319016	50 %	0 %	25 %	25 %	333986521
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5122	NC_015574	TGTT	2	8	319082	319089	0 %	75 %	25 %	0 %	333986521
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5124	NC_015574	T	6	6	319305	319310	0 %	100 %	0 %	0 %	333986522
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5497	NC_015574	AACGTT	2	12	342687	342698	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333986541
5498	NC_015574	GAA	2	6	342699	342704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986541
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